Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BPC6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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