Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sfr1Q8BP27 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sfr1Q8BP27 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sfr1Q8BP27 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sfr1Q8BP27 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sfr1Q8BP27 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sfr1Q8BP27 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sfr1Q8BP27 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sfr1Q8BP27 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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