Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan12Q8BKT6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms