Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms