Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms