Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms