Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Liat1Q810M6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms