Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clec16aQ80U30 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clec16aQ80U30 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec16aQ80U30 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms