Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms