Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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