Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms