Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms