Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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