Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwistnbQ78WZ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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