Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpv1Q704Y3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms