Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SpopQ6ZWS8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms