Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms