Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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