Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx13Q6PHS6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx13Q6PHS6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx13Q6PHS6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx13Q6PHS6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx13Q6PHS6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms