Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms