Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms