Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim37Q6PCX9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim37Q6PCX9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trim37Q6PCX9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trim37Q6PCX9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trim37Q6PCX9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trim37Q6PCX9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Trim37Q6PCX9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim37Q6PCX9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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