Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms