Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sbno1Q689Z5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Sbno1Q689Z5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno1Q689Z5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Sbno1Q689Z5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno1Q689Z5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno1Q689Z5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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