Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms