Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms