Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms