Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EsrrbQ61539 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms