Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms