Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamb3Q61087 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms