Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurod1Q60867 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Neurod1Q60867 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Neurod1Q60867 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Neurod1Q60867 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurod1Q60867 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurod1Q60867 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurod1Q60867 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurod1Q60867 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms