Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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