Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms