Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TefmQ5SSK3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TefmQ5SSK3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms