Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms