Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms