Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms