Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms