Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trat1Q3UU67 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms