Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6899Q3USS0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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