Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf48Q3US17 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms