Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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