Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ulk3Q3U3Q1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ulk3Q3U3Q1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ulk3Q3U3Q1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ulk3Q3U3Q1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ulk3Q3U3Q1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ulk3Q3U3Q1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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