Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms