Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms