Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms