Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hhla1Q3TYV2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hhla1Q3TYV2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms