Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
InipQ3TXT3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms