Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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