Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms